Het plan ‘Holwerd aan zee’, initiatief van een werkgroep van bewoners, gaat om het verbinden van Holwerd met de Waddenzee. Naast economische kansen voor het dorp en omgeving, biedt dat ook kansen voor herstel van de ecologische connectie tussen Waddenzee en achterland. A&W heeft de mogelijke natuurdoelen uitgewerkt en beheer- en inrichtingsadviezen geformuleerd. Getij, morfologie, overstromingsfrequentie en de aanvoer van zoet water uit het achterland zijn daarbij sturend. Met name een geleidelijke zoet/zoutovergang – tegenwoordig een zeldzaam fenomeen in Nederland – is ecologisch waardevol. Bij een juiste inrichting wordt vismigratie tussen Waddenzee en Friese boezem weer mogelijk, wat vooral van belang is voor diadrome vissen. Een brakwaterzone met variatie in waterdiepte, temperatuur en begroeiing biedt paai- en opgroeigelegenheid aan o.a. estuariene vissen. Ook ontstaat ruimte voor wad, slik en pionier- en lage kweldervegetaties. Op bij eb droogvallende delen kunnen wadvogels foerageren. Voorgesteld wordt om broedeilanden voor wadvogels aan te leggen; deze kunnen ook fungeren als hoogwatervluchtplaats.